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小编点评

层次数据模型

17日，記者從浙江省農科院獲悉，該院水生生物研究所小黃魚科研團隊與美國奧本大學、廈門大學合作，首次完成小黃魚全基因組組裝注釋與精細圖譜繪製，為建立小黃魚基因組選擇育種、培育高產抗病優質良種提供了基因資源和技術手段，相關研究論文近日在線發表於學術期刊《分子生態學資源》上。

小黃魚是中國重要的海產經濟魚，味道鮮美，廣受青睞。2021年，浙江省農科院等單位通過連續8年產學研聯合攻關，突破了野生小黃魚馴活、人工催產和全人工規模化繁育關鍵技術，實現小黃魚網箱養殖規模化生產。隨著小黃魚全養殖產業的擴大和科研的深入，破譯小黃魚基因組，發掘生長、性別決定等相關重要功能基因成為擺在科研工作者麵前的重要課題。

全人工養殖的小黃魚科研團隊供圖

“黃魚屬擁有東海四大海產中的小黃魚與大黃魚兩個重要經濟魚類，雖然它們形態和染色體核型相似，但是黃魚屬物種之間的遺傳關係尚未明確。”論文第一作者、浙江省農科院水生所助理研究員謝慶平博士介紹，本研究通過結合四類基因組測序技術，構建了小黃魚染色體水平的基因組精細圖譜；揭示小黃魚基因組大小為706 Mb，注釋基因為25233個；進化分析表明小黃魚與大黃魚親緣關係最近，大概在2540萬年前開始分化。

謝慶平介紹，魚類雌雄同體和雌雄異體的演化方向，在學術界仍然是一個有待解決的有趣謎團。此次研究通過轉錄組學、比較基因組學以及分子生物學的技術方法，鑒定出dmrt1基因為小黃魚的雄性特異性基因，且dmrt1基因序列的演化可以作為魚類中雌雄同體現象產生的生物標記。

論文通訊作者、浙江省農科院水生所所長樓寶研究員表示，小黃魚全基因組的解譯和基因組精細圖譜的繪製，對於海洋漁業資源保護、小黃魚養殖產業化以及分子遺傳育種技術的研究意義重大，可以為科研人員開展小黃魚種質資源挖掘保護、經濟性狀的遺傳解析和建立以基因組為基礎的輔助育種平台。

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